Gérer le phoma grâce au choix variétal
Gérer le phoma grâce au choix variétal
Le choix variétal, associé à quelques mesures agronomiques, permet de gérer le risque phoma. Pour cela, les variétés TPS (très peu sensible) sont à privilégier : elles permettent de limiter l’impact de la maladie sur la culture, et de maintenir des pressions faibles en phoma en limitant l’inoculum pour les années suivantes.
La résistance des variétés de colza au phoma repose sur 2 types de mécanismes : la résistance quantitative, et les gènes de résistances spécifiques. Les variétés possédant de la résistance exclusivement quantitative ont un comportement stable. L’efficacité des gènes de résistance spécifique dépend quant à elle des populations de phoma, qui peuvent différer entre régions et dans le temps. L’utilisation de variétés ayant des résistances spécifiques efficaces ou partiellement efficaces (Rlm3, Rlm7, RlmS, LepR1…) favorise en effet la sélection de souches de phoma contournant ces résistances, engendrant ainsi peu à peu leur perte d’efficacité. Ainsi, les variétés ayant ces résistances doivent être utilisées en alternance avec des variétés ne possédant pas ce ou ces gènes de résistance.
Les types de résistance au phomaLa résistance des variétés de colza vis-à-vis du phoma repose sur deux types de mécanismes : Les variétés peuvent cumuler des facteurs de résistance quantitative, qui par addition, leur confèrent un comportement peu sensible à très peu sensible au phoma. Les résistances quantitatives présentent l’avantage d’être efficaces contre toutes les souches de phoma (Leptosphaeria maculans), et sont durables dans le temps. Ces mécanismes de résistance se mettent en place tout au long du développement de la culture : même avec beaucoup de macules, les variétés présentant ce type de résistance sont au final peu impactées par le phoma. La résistance peut également être apportée par des gènes de résistance spécifique. Les résistances spécifiques agissent au stade précoce de l’infection. Elles sont conférées par des gènes, nommés Rlm ou LepR, qui bloquent spécifiquement le développement des souches de phoma reconnues par ce gène. Ces deux types de résistances ne sont pas exclusifs ! Les variétés peuvent à la fois posséder des résistances quantitatives et des résistances spécifiques ; c’est pourquoi, certaines variétés peuvent rester très peu sensibles au phoma, même lorsqu’elles portent un gène Rlm (ou LepR) contourné, tandis que d’autres variétés voient leur niveau de résistance se dégrader. Ce n’est toutefois que lorsque l’évolution des populations de phoma engendre une perte d’efficacité de ces gènes Rlm (ou LepR) que ce niveau de résistance quantitative se révèle. Les variétés possédant de la résistance exclusivement quantitative ont quant à elles un comportement stable dans le temps. |
Comment choisir les variétés ?
Pendant longtemps, seul le gène Rlm7 était jugé efficace sur le territoire ; par la suite, c’est le couple Rlm3 / Rlm7 qui montrait une très bonne efficacité. Au fil des années, avec l’utilisation de variétés présentant ces gènes de résistance, le gène Rlm7, couplé ou non à Rlm3, a perdu de son efficacité ; en contrepartie, des variétés présentant de nouveaux gènes de résistance efficaces ont vu le jour sur le marché. Dans ce contexte, Terres Inovia vous donne toutes les informations sur les variétés, et ses recommandations pour gérer la durabilité de ces solutions à la parcelle : choisir ses variétés selon son contexte local et son historique
L’utilisation des variétés ayant des résistances spécifiques efficaces doit être raisonnée et pratiquée en alternance avec des variétés ne possédant pas ce ou ces gènes de résistance. Depuis plusieurs années, grâce aux travaux de recherche et de sélection, des variétés sans gène de résistance spécifique efficace montrent de très bons niveaux de résistance quantitative au phoma (classées TPS) : cette alternance des variétés n’accroit donc pas le risque maladie sur la parcelle et contribue à la durabilité de la gestion du phoma.
En termes d’efficacité, les nouvelles résistances RlmS et LepR1 confèrent à ce jour un très bon niveau de résistance sur tout le territoire. Les populations de phoma étant en cours d’évolution pour leur comportement vis-à-vis des gènes de résistance Rlm3 et Rlm7, ces deux gènes confèrent à ce jour des niveaux de résistance de plus en plus faibles chaque année (avec des variations sur les secteurs).
Pour permettre à chacun d’adapter son choix variétal à la situation de la parcelle, Terres Inovia communique depuis 2019 sur les gènes de résistance présents dans les variétés. L’information sur la présence du gène LepR1 a été ajoutée en 2023 avec les premières variétés déployées en France et possédant ce gène.
Variété | Année d'inscription | Représentant | Comportement PHOMA | Dernière année d'éval phoma | Phoma | Phoma | Phoma | Phoma |
ABSOLUT (2) | 2018 | LG Semences | PS | 2020 |
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ACROPOLE (2) | 2018 | LG Semences | S/PS* | 2020 |
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ADDITION (2) | 2018 | Soufflet Seeds | PS | 2018 | ü |
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ALASCO (1) | 2017 | LG Semences | PS | 2018 |
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ALEZZAN | 2016 | RAGT Semences | TPS | 2017 |
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ALLESANDRO KWS (2) | 2018 | KWS Maïs France | PS | 2018 |
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AMAZZONITE | 2018 | Semences de France | PS | 2018 |
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Extrait du guide de culture Colza
L’outil Terres Inovia myVar permet d’identifier les variétés adaptées à chaque situation.
Pourquoi Terres Inovia donne également l’information sur la date de dernière évaluation du phoma ?
Le comportement S/PS/TPS est évalué au champ dans un réseau multilocal sur une à deux années ; toutefois les populations de phoma évoluant, les conditions d’évaluation ne sont pas les mêmes : par exemple, des variétés possédant Rlm7 et évaluées TPS dans un contexte où ce gène était encore très efficace et bloquait les infections pourraient avoir un comportement différent aujourd’hui : plus l’année d’évaluation est récente (- de 3 ans), plus l’information est fiable aujourd’hui. C’est donc un point d’attention à avoir, pour les variétés ayant des gènes de résistance spécifique efficace. Les variétés dont la résistance repose exclusivement sur de la résistance quantitative ont un comportement stable dans le temps.
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Caractérisation par analyses moléculaires (PCR et HRM) des gènes d’avirulence AvrLm1, 4, 6 et 7 chez des populations de phoma.
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